با تأسیس دانشکده علوم دانشگاه اصفهان در سال ۱۳۴۲ و پذیرش دانشجو در رشته های شیمی و فیزیک، تدریس شیمی در شهر اصفهان عملاً آغاز گردید. از مهرماه ۱۳۴۳ گروه شیمی به صورت گروهی مستقل فعالیت خود را آغاز نمود. از سال ۱۳۴۴ این گروه در مقطع کارشناسی در رشته های شیمی محض و دبیری شیمی و از سال ۱۳۶۷ در رشته شیمی کاربردی (مقطع کارشناسی) دانشجو پذیرفت. در بین سال های ۱۳۶۴ تا ۱۳۷۳ دوره های کارشناسی ارشد و دکتری در شاخه های مختلف شیمی راه اندازی گردید. در سال ۱۳۹۱ با تصویب هیات امناء دانشگاه، این گروه به دانشکده شیمی ارتقاء یافت.

دانشکده شیمی دانشگاه اصفهان دارای آزمایشگاه ها، دستگاه ها و تجهیزات پیشرفته و بعضاً منحصربه فرد است و می توان آن را یکی از مجهزترین دانشکده های شیمی دانشگاه های کشور به حساب آورد. علاوه بر کلاس های آموزشی و دفاتر کار استادان و کارشناسان، وجود ۸ آزمایشگاه آموزشی و ۲۴ آزمایشگاه پژوهشی در یک ساختمان مستقل با زیربنای ۱۰۵۰۰ متر مربع و دستگاه های متعدد آزمایشگاهی و تحقیقاتی از جمله امکانات اختصاصی این دانشکده به شمار می آید.